用RStudio把文字和統計output以Latex形式輸出成pdf的方法：knitr
最終目標就是用RStudio做出如下圖，包含內文跟統計結果的pdf文件
工具
首先，工欲善其事必先利其器，所以該抓的軟體都不可以落。▲Latex：我安裝了Miktex2.9，順帶一提我在寫論文過程中使用的編輯器是Texmaker 4.5，Texmaker 4.5可以即時預覽pdf我覺得很方便，不過不知道哪裡設定出問題，Texmaker每次要幫我安裝package的時候都失敗，我得特地開Miktex的package manager自己手動安裝特定的package。
▲R\RStudio：反正安裝當下的最新版本就對了，值得注意的是要安裝在沒有中文的路徑裡，我安裝時沒有改，就跑去了有中文的資料夾裡面，平常使用沒有問題，但是在抓取編寫pdf文件所需的knitr package時一直卡住。
RStudio設定
RStudio上方選單裡選Tool→Global Options以後找到Sweave，把第一個Weave Rnw files改成knitr(如下圖)。
測試
接著新增檔案 R Sweave檔如下圖
\documentclass{article}
\begin{document}
\end{document}
如果上面有一行灰底的系統提示告訴你還沒裝knitr，那就去用你安裝的latex的typesetting system(如Miktex 2.9)的package manager安裝knitr package吧。
如果安裝好以後重開新檔沒顯示提示訊息，那就可以像寫latex文件一樣在\begin{document}和\end{document}之間隨便寫幾行字，接著按右上角的 Compile PDF，系統會問你要存在哪裡，選好以後應該就可以用RStudio已經生成一個很普通的pdf文件了。
加入R-code
如果想要說明文字和R的指令+R的output table交錯顯示，只要記住凡是要切到R的指令時就如以下把code用<<>>=和@包起來，這不需要自己打，按Compile PDF右邊的綠色圖示 Insert a new code chunk即可。
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這是測試耶耶
<<>>=
data <- read.csv(choose.files(), header = TRUE, sep = "\t")
attach(data)
@
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這樣結果就會如最上面的第一張圖那樣了。
相關實用資訊
▲改邊界：根據實驗，這產出的pdf檔的邊界實在太寬了，很多table的內文都會斷行，所以可以在\documentclass{article}下面加 \usepackage[a4paper, total={6in, 8in}]{geometry}，這樣邊界的結果會比較像正常的文件。其實就把他當成寫latex就對了。
▲移除消去頁碼：此文件會在下方中央自動生成頁數，但因為我想把此pdf檔加到論文最後的附錄，我不想要他有自己的頁數所以就可以把\pagenumbering{gobble}放在\begin{document}的後面，這樣就移除全部的頁碼了
▲把pdf檔接在主要的文件後面而且接續前方頁碼：這就不是在RStudio裡面編輯了，必須切回Texmaker。首先要安裝pdfpages這個package，並載入\usepackage{pdfpages}，接著在希望插入此pdf文件(假設叫Routput.pdf)的地方寫\includepdf[pages=-,pagecommand={}]{Routput.pdf}，這樣就會無縫接軌了！
說到這裡總算結束了，希望有幫上忙~
